Im Turm des einstmals mächtigen "Doms" von Marienhafe befindet sich ein kleines, dem berühmten und berüchtigtem Seeräuber Klaus Störtebeker gewidmetes Museum.
Der Sage nach soll Störtebeker hier im ausgehenden 14. Jahrhundert Unterschlupf gefunden und im Turm der Kirche sein Hauptquartier untergebracht haben.
Damals lag Marienhafe noch direkt am Meer, was den Piraten der Sage nach die Möglichkeit bot, ihre Schiffe an der Wallanlage der Kirche festzumachen. Dazu kam, dass der Hafen von Marienhafe für Fremde nur schwer zugänglich gewesen sein soll und daher ein hervorragendes versteck darstellte.